芽孢桿菌種類繁多目前常用的有：枯草芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌、巨大芽孢桿菌、蘇云金芽孢桿菌、納豆芽孢桿菌、凝結芽孢桿菌、短小芽孢桿菌等。其被廣泛應用于畜牧水產養殖、農業種植、食品保健等行業。

芽孢桿菌能提高動物生產性能是其產生多種消化酶的一個重要體現。研究表明，芽孢桿菌能產生多種消化酶，幫助動物對營養物質的消化吸收。芽孢桿菌具有較強的蛋白酶、淀粉酶和脂肪酶活性，同時還具有降解飼料中復雜碳水化合物的酶，如果膠酶、葡聚糖酶、纖維素酶等，這些酶能夠破壞植物飼料細胞的細胞壁，促使細胞的營養物質釋放出來,并能消除飼料中的抗營養因子，減少抗營養因子對動物消化利用的障礙。